Chiều 5/7, vòng bảng tiếp tục diễn ra lượt trận thứ hai. Ở bảng A, SLNA đã vượt qua Bình Dương với tỷ số 1-0 bằng bàn thắng duy nhất của Nguyễn Vi Mạnh Hùng. Trong lúc đó,  PVF đánh bại Becamex  Bình Dương với tỷ số 3-0 sau 3 pha lập công của Nguyễn Khắc Phong, Nguyễn Bá Huy và Nguyễn Minh Hải. Sau 2 lượt trận, SLNA toàn thắng được 6 điểm trong khi PVF có 3 điểm còn Bình Dương và Becamex Bình Dương chỉ có 1 điểm. Hơn đội đứng thứ ba đến 5 điểm trong lúc vòng bảng chỉ còn 1 lượt đấu nên SLNA đã sớm giành 1 vé ở bảng A vào tứ kết.

Ở bảng B, SHB Đà Nẵn đã hòa Haduwaco Hải Dương với tỷ số 2-2 dù có 2 bàn thắng dẫn trước. Trong lúc đó, Huế vượt qua Ves Bà Rịa Vũng Tàu với tỷ số 2-1. Sau 2 trận, SHB Đà Nẵng đang dẫn đầu với 4 điểm trong lúc Huế và Ves Bà Rịa Vũng Tàu cùng có 3 điểm trong lúc Haduwaco Hải Dương. Với điểm số này, cả 4 đội đều còn hy vọng giành vé vào tứ kết cũng như nguy cơ bị loại nên lượt cuối sẽ rất gay cấn. 

Tại bảng C, Hà Tĩnh tiếp tục gây ấn tượng khi vượt qua Quảng Nam với tỷ số sít sao 1-0. Dương Văn Minh là tác giả của bàn thắng duy nhất mang trọn 3 điểm về cho Hà Tĩnh. Cũng ở bảng này, Nam Định đánh bại Navy Phú Nhuận TP.HCM với tỷ số 4-0 bằng 4 bàn thắng của Vì Gia Huy (2 bàn), Triệu Đình Đăng và Lương Trung Dương. Sau 2 trận, Hà Tĩnh có được 6 điểm, hơn đội đứng thứ ba là Quảng Nam đến 5 điểm trong khi vòng bảng chỉ còn 1 lượt trận nên đã sớm giành vé vào tứ kết.

Ở bảng C, HAGL hòa Phú Thọ 0-0 trong lúc Hà Nội thua đậm TP.HCM với tỷ số 1-4. Cấn Bằng Phi ghi bàn danh dự cho Hà Nội sau khi Huỳnh Bùi Gia Khiêm (2 bàn), Phan Thanh Bình bà Thạch Ngọc Khôi có 4 bàn thắng cho TP.HCM. Sau 2 lượt đấu, HAGL đang dẫn đầu với 4 điểm, TP.HCM được 3 điểm trong lúc Phú Thọ được 2 điểm còn Hà Nội có 1 điểm. Cục diện bảng này cũng giống như bảng B nên phải đợi đến lượt cuối cùng mới xác định cả 2 vé vào tứ kết.